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Transcriptómica: Procesamiento y anotación de datos
Características
Modalidad
Online en vivo y/o grabado.
Duración
20 horas totales (15 horas en 5 sesiones y 5 horas extracurriculares)
Fechas
19, 26 de octubre, 2, 16 y 23 de noviembre de 2024
Horario
10:00 AM a 1:00 PM. Hora de la Ciudad de México.
Diploma
Constancia con valor curricular por las horas impartidas.
Plataforma
Google meet y Google classroom.
Sobre el curso
El objetivo del curso es:
El curso permitirá conocer la estructura básica de una librería generada por illumina, se revisará el manejo del software de análisis de calidad y diseñar estrategias para el procesamiento con la finalidad de generar un reporte de anotación mediante blastX y P contra bases de datos.
Dirigido a estudiantes de posgrado interesados en aprender a procesar librerías generadas por RNA-seq de Illumina y llevar a cabo los análisis básicos de calidad y anotación del ensamblaje.
Características
Que aprenderás
• Conocer la estructura básica de una librería generada por illumina
• Aprender a utilizar el software de análisis de calidad y diseñar estrategias para el procesamiento.
• Aprender el fundamento del ensamble realizado por Trinity y analizar la calidad del mismo.
• Generar un reporte de anotación mediante blastX y P contra bases de datos.
Módulos del curso
1. Introducción a Linux para bioinformática.
2. Fundamentos de la biología molecular y la transcripción.
3. Análisis transcriptómico.
4. Ensamble y anotación de datos transcriptómicos.
5. Análisis de expresión diferencial.
6. Anotación y enriquecimiento funcional.
7. Integración de datos ómicos.
8. Consideraciones éticas y de bioinformática.
TEMARIO COMPLETO:
Ponente
M. en C. Verónica Torres Banda
Licenciada en biología y maestra en Ciencias Químico Biológicas, egresada de la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del IPN, actualmente avanza en su Doctorado en Ciencias Químico Biológicas, ha trabajado con filogenias e historia demográfica, con datos mitocondriales y microsatélites.
¿Cómo
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Teléfono: 55 9280 9670
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Ubicación
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